科学

进化你自己的生命:生物起源介绍

我过去报道的大部分软件都集中在工程学、化学或物理学领域。然而,越来越多的软件包正在编写中,将计算资源应用于生物学问题。因此,在本文中,我想介绍一个名为 Biogenesis 的特定生物学软件包。

使用 Python 进行科学研究

介绍 Anaconda,一种用于科学研究的 Python 发行版。过去,我研究过几种使用 Python 进行科学计算的方法,但我从未真正介绍过如何设置和使用 Python 本身,使其更容易进行科学工作。Anaconda 正是做到了这一点。

使用 Python 可视化分子

介绍 PyMOL,一个用于研究化学结构的 Python 包。过去,我研究过几个用于计算化学的开源软件包,但在本文中,我介绍一个用 Python 编写的名为 PyMOL 的软件包。

Emacs 用于科学

我通常介绍执行实际计算以推进科学知识的软件包,但在这里,我将探索科学计算武器库中一个稍微陌生的工具。

切片科学数据

在之前的文章中,我介绍过分析图像信息或实际生成图像数据以供进一步分析的科学软件。在本文中,我将介绍一个您可以用来分析作为医疗诊断工作一部分生成的图像的工具。

Linux 上的图像处理

我在此领域介绍过几个科学软件包,它们可以生成您数据和工作的漂亮图形表示,但我在这方面并没有深入研究。因此,在本文中,我将介绍一个名为 ImageJ 的流行图像处理软件包。

在 Linux 上解决物理问题

几年前,我写了一篇关于使用 Elmer 解决复杂物理问题的文章。从那时起,Elmer 取得了很大的进步,所以我认为值得重新审视一下这款模拟软件。

Jmol:使用 Java 查看分子

让我们重新深入研究一些化学软件,看看您可以在 Linux 机器上完成哪些类型的工作。具体来说,让我们看看 Jmol,这是一个 Java 应用程序,既可以作为桌面应用程序使用,也可以作为基于 Web 的小程序使用。

Gabedit:化学门户

许多化学软件应用程序可用于在 Linux 上进行科学工作。我在本杂志之前的几期中介绍过其中几个,它们都有各自独特的专长——某些领域一个可能比另一个工作得更好。因此,根据您的研究内容,您可能需要使用多个软件包来处理所有工作。

分析视频以获得乐趣和利润

人们的手机以及可能内置在其中的各种传感器是几乎每个人都随身携带的科学数据记录来源。虽然传感器的选择因手机而异,但几乎所有手机都有摄像头。在本文中,我将介绍一款名为 Tracker 的软件,该软件可用于分析您拍摄的实验视频。

浏览器中的 Pythonic 科学

过去,如果您想要一个友好的 Python 编程环境,您会使用 Ipython。Ipython 项目实际上由三部分组成:标准控制台界面、基于 Qt 的 GUI 界面以及您可以使用 Web 浏览器连接的 Web 服务器界面。

桌面化学

对于本文,我想介绍另一个化学应用程序——具体来说是 BKChem,一个免费的化学绘图程序。与其他许多化学应用程序不同,BKChem 既提供了一个用于构建分子的漂亮 GUI,又提供了一组化学分析工具来查看新构建分子的属性。

适用于所有人的史密斯圆图

过去,我介绍过几个在进行电气工程时有用的不同程序。在本文中,我想介绍一个名为 linsmith 的程序,它可以帮助您进行计算或查看不同参数的行为方式。

步入科学

在之前的文章中,我研究过几个库或专用应用程序,它们可以用来模拟某种物理过程。但有时您希望能够同时以交互模式模拟几个不同的过程。

Linux 上的 Nightfall

过去,我研究过一些通用的天文程序,这些程序对您在观星生涯中可能需要完成的许多任务都很有帮助。但是,一些特定的工作更加复杂,需要专门的软件来进行相关计算,因此,在这里,让我们看看 Nightfall。

KDE 的天文

虽然我过去介绍过大量的科学应用程序,但我还没有真正研究过 KDE 桌面环境中可用的太多选项。这主要是由于我自己在使用基于 GTK 的桌面环境时的偏见,但现在我想看看一些适用于真正喜欢在自己的机器上使用 KDE 的用户的软件包。

Makeblock 的 mBot

Makeblock 推出的新型儿童友好型 mBot 被宣传为科学、技术、工程和数学 (STEM) 教育学习工具。

Android 上的符号数学

在本文中,我将回到 Android 上的便携式科学软件。在之前的文章中,我介绍了一个名为 xcas/giac 的程序。该程序是一个开源引擎,用于处理数学方程的符号操作。由于它是开源的,因此已被移植到多个不同的平台。

冥王星和 Linux,不被看好的超级英雄

我是一个太空迷。这可能并不令人惊讶,但我的迷恋程度可能很深。我几乎拥有 NASA 发布的所有太空照片。我在我的 Google 日历上安排 NASA.tv 的任务简报,就好像它们是专门为我准备的。我曾经让我的孩子们在我们的电视上看航天飞机发射,即使他们正在做作业!

化学家的 ABINIT

高性能计算集群上最大的用户群体必须是化学家。他们的 CPU 年计数绝对位居榜首。由于这种大量使用,几个不同的软件包已成为大多数计算化学研究人员使用的标准工具。